Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMD9O00233 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD9O00233 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.1 ms