Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIEO00221 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFKBIEO00221 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFKBIEO00221 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms