Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QQQ9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QQQ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QQQ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QQQ9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QQQ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QQQ9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QQQ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QQQ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QQQ9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QQQ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QQQ9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QQQ9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QQQ9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QQQ9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QQQ9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QQQ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QQQ9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QQQ9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QQQ9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QQQ9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QQQ9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QQQ9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QQQ9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QQQ9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QQQ9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QQQ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QQQ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QQQ9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QQQ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QQQ9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QQQ9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QQQ9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QQQ9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QQQ9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QQQ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QQQ9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QQQ9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QQQ9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QQQ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QQQ9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QQQ9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QQQ9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QQQ9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QQQ9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QQQ9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QQQ9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QQQ9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QQQ9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QQQ9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QQQ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QQQ9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QQQ9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QQQ9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QQQ9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QQQ9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QQQ9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QQQ9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QQQ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QQQ9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QQQ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QQQ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QQQ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QQQ9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QQQ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QQQ9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QQQ9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QQQ9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QQQ9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QQQ9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QQQ9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms