Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01387J3KSC0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms