Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C1H1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C1H1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C1H1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C1H1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C1H1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C1H1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C1H1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C1H1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C1H1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C1H1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C1H1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C1H1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C1H1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
H7C1H1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H7C1H1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H7C1H1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H7C1H1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H7C1H1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H7C1H1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H7C1H1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H7C1H1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H7C1H1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H7C1H1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H7C1H1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H7C1H1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H7C1H1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms