Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C0C1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C0C1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C0C1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C0C1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C0C1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C0C1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C0C1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C0C1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C0C1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C0C1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C0C1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C0C1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C0C1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C0C1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C0C1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C0C1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C0C1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C0C1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H7C0C1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C0C1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C0C1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C0C1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C0C1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C0C1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C0C1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C0C1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C0C1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C0C1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C0C1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C0C1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C0C1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C0C1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C0C1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C0C1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C0C1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C0C1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C0C1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C0C1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C0C1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C0C1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C0C1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C0C1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C0C1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C0C1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C0C1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C0C1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C0C1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C0C1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C0C1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C0C1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C0C1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H7C0C1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H7C0C1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H7C0C1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H7C0C1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H7C0C1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H7C0C1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H7C0C1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H7C0C1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
H7C0C1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C0C1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C0C1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C0C1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C0C1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C0C1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C0C1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C0C1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C0C1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C0C1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C0C1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C0C1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C0C1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C0C1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C0C1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C0C1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C0C1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C0C1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C0C1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C0C1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C0C1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C0C1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C0C1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C0C1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms