Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BNH8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BNH8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BNH8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BNH8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BNH8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BNH8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H3BNH8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H3BNH8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
H3BNH8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H3BNH8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BNH8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BNH8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BNH8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BNH8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BNH8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BNH8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BNH8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BNH8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BNH8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BNH8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BNH8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BNH8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BNH8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BNH8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BNH8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BNH8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BNH8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BNH8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BNH8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BNH8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BNH8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BNH8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BNH8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BNH8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BNH8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BNH8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BNH8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BNH8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BNH8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BNH8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BNH8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BNH8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BNH8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BNH8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BNH8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BNH8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BNH8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BNH8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BNH8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BNH8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BNH8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BNH8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BNH8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BNH8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BNH8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BNH8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BNH8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BNH8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BNH8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BNH8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BNH8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BNH8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BNH8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BNH8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BNH8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BNH8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BNH8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BNH8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BNH8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BNH8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BNH8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BNH8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BNH8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BNH8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BNH8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BNH8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BNH8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BNH8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BNH8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BNH8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BNH8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BNH8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BNH8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BNH8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BNH8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms