Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PQ18 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PQ18 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PQ18 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PQ18 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PQ18 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PQ18 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PQ18 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E9PQ18 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PQ18 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PQ18 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PQ18 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PQ18 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PQ18 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PQ18 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PQ18 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PQ18 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PQ18 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E9PQ18 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PQ18 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PQ18 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PQ18 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PQ18 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PQ18 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PQ18 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PQ18 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PQ18 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PQ18 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PQ18 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E9PQ18 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PQ18 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PQ18 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PQ18 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PQ18 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PQ18 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PQ18 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PQ18 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PQ18 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PQ18 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E9PQ18 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E9PQ18 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E9PQ18 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E9PQ18 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PQ18 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PQ18 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PQ18 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PQ18 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PQ18 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PQ18 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E9PQ18 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PQ18 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PQ18 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PQ18 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PQ18 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PQ18 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PQ18 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PQ18 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PQ18 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PQ18 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PQ18 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E9PQ18 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PQ18 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PQ18 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PQ18 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PQ18 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PQ18 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PQ18 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PQ18 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PQ18 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PQ18 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PQ18 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PQ18 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PQ18 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PQ18 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PQ18 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PQ18 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PQ18 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PQ18 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PQ18 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PQ18 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PQ18 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PQ18 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PQ18 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PQ18 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PQ18 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PQ18 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PQ18 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PQ18 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms