Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PATL2C9JE40 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PATL2C9JE40 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PATL2C9JE40 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms