Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YJEFN3A6XGL0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YJEFN3A6XGL0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms