Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCT8L1PA6NM43 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT8L1PA6NM43 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms