Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM23A6NLE4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM23A6NLE4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms