Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85CA6NKD9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC85CA6NKD9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms