Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB15A6NHN6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPIPB15A6NHN6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms