Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C5orf60A6NFR6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C5orf60A6NFR6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms