Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms