Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EME2A4GXA9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EME2A4GXA9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EME2A4GXA9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EME2A4GXA9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EME2A4GXA9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EME2A4GXA9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EME2A4GXA9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EME2A4GXA9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EME2A4GXA9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EME2A4GXA9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EME2A4GXA9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms