Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms