Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC162PA2VCL2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms