Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPAARA0A1B0GVQ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms