Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0U1RQF3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQF3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms