Protein–RNA interactions for Protein: A0A096LPI6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A096LPI6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A096LPI6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A096LPI6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms