Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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