Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EMILIN3Q9NT22 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms