Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FANCFQ9NPI8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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