Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms