Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms