Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGIP1Q9BQI5 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms