Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YME1L1Q96TA2 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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