Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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