Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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