Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms