Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2A3Q93084 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms