Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG4AQ8WYN0 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4AQ8WYN0 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms