Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC71Q8N4P6 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms