Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOT2Q8IXI1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms