Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms