Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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USP43Q70EL4 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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USP43Q70EL4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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USP43Q70EL4 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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USP43Q70EL4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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USP43Q70EL4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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USP43Q70EL4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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USP43Q70EL4 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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