Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4L3Q6VB84 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms