Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC9A4Q6AI14 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC9A4Q6AI14 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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