Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGAP9Q5VTM2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms