Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms