Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LMCD1-AS1-201ENST00000420095 2144 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FDXACB1-201ENST00000260257 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MSL3-207ENST00000398527 2324 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF221-204ENST00000592350 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GRHL3-201ENST00000236255 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA4A-203ENST00000368284 2981 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C3AR1-201ENST00000307637 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNB1-208ENST00000576360 1837 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CRP-201ENST00000255030 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CTBP1-AS2-202ENST00000505364 2423 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AKR1B10-201ENST00000359579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms