Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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