Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms