Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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