Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms