Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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NBR1Q14596 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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NBR1Q14596 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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NBR1Q14596 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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NBR1Q14596 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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NBR1Q14596 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
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NBR1Q14596 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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NBR1Q14596 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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NBR1Q14596 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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NBR1Q14596 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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NBR1Q14596 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NBR1Q14596 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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