Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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