Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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